Program BIPA adalah program pembelajaran keterampilan berbahasa Indonesia (berbicara, menulis, membaca, dan mendengarkan) bagi penutur asing. Pembelajaran BIPA memerlukan kurikulum, bahan ajar (termasuk buku ajar dan kamus dwibahasa), metode pembelajaran yang tepat, dan media belajar audio-visual yang dirancang secara khusus. 

Program BIPA di IAIN Madura tergolong program baru, yaitu terbentuk pada tanggal 16 Agustus 2022 sesuai dengan SK Rektor Nomor: B-2874/In.38/R/P.00.9/08/2022 tentang Tim Bahasa Indonesia Bagi Penutur Asing (BIPA) UPT Bahasa IAIN Madura. Pelaksanaan program BIPA pada saat ini berada di bawah naungan UPT. Bahasa IAIN Madura. Adapun tim BIPA saat ini dikoordinir oleh dosen Tadris Bahasa Indonesia, yaitu Sahrul Romadhon, M.Pd. yang saat ini sebagai pengajar mahasiswa BIPA asal Rusia. Serta dosen Tadris Bahasa Indonesia lainnya, seperti Dr. Moh. Hafid Effendy, M.Pd., Agus Purnomo Ahmad Putikadyanto, M.Pd., Agik Nur Effendi, M.Pd., Albaburrahim, M.Pd., Mochammad Arifin Alatas, M.Pd., dan Liana Rochmatul Wachidah, M.Pd.